Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trem1Q9JKE2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trem1Q9JKE2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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