Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scamp5Q9JKD3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms