Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3glb1Q9JK48 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3glb1Q9JK48 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms