Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cngb3Q9JJZ9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms