Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cnga3Q9JJZ8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms