Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2j1Q9JJZ4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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