Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alyref2Q9JJW6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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