Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra4Q9JJT2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra4Q9JJT2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms