Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Riox1Q9JJF3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Riox1Q9JJF3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Riox1Q9JJF3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Riox1Q9JJF3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Riox1Q9JJF3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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