Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc86Q9JJ89 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms