Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpf2Q9JJ80 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms