Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smad9Q9JIW5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad9Q9JIW5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms