Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1Q9JIT0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms