Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms