Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1aQ9JIC3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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