Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn12Q9ET43 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms