Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim39Q9ESN2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trim39Q9ESN2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trim39Q9ESN2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trim39Q9ESN2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms