Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ush1cQ9ES64 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ush1cQ9ES64 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms