Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc4Q9ES56 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc4Q9ES56 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms