Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb3Q9ERD7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms