Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms