Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms