Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmg20aQ9DC33 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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