Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fundc1Q9DB70 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fundc1Q9DB70 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms