Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med27Q9DB40 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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