Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tmem239Q9DA47 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tmem239Q9DA47 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem239Q9DA47 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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