Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Samd8Q9DA37 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms