Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Snx5Q9D8U8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Snx5Q9D8U8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Snx5Q9D8U8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Snx5Q9D8U8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Snx5Q9D8U8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx5Q9D8U8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Snx5Q9D8U8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Snx5Q9D8U8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Snx5Q9D8U8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms