Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8H7

Oma1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oma1Q9D8H7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Oma1Q9D8H7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Oma1Q9D8H7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms