Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fip1l1Q9D824 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms