Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Capn9Q9D805 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms