Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisa5Q9D7I0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa5Q9D7I0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa5Q9D7I0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa5Q9D7I0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Shisa5Q9D7I0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisa5Q9D7I0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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