Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbe1Q9D6Y9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbe1Q9D6Y9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms