Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms