Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm5Q9D6G9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms