Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms