Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D5Q8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D5Q8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms