Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms