Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Iqcf3Q9D498 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Iqcf3Q9D498 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms