Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X5

Pacrgl, PACRG-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrglQ9D3X5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PacrglQ9D3X5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PacrglQ9D3X5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PacrglQ9D3X5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PacrglQ9D3X5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PacrglQ9D3X5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrglQ9D3X5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrglQ9D3X5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms