Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933428M09RikQ9D3X3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933428M09RikQ9D3X3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms