Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pus10Q9D3U0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pus10Q9D3U0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms