Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snx20Q9D2Y5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snx20Q9D2Y5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snx20Q9D2Y5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snx20Q9D2Y5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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