Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms