Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Klhdc8bQ9D2D9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Klhdc8bQ9D2D9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Klhdc8bQ9D2D9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Klhdc8bQ9D2D9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Klhdc8bQ9D2D9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Klhdc8bQ9D2D9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Klhdc8bQ9D2D9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhdc8bQ9D2D9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms