Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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