Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm12Q9D0R8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms