Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp11Q9CZJ1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms