Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms