Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms